Hai KCN đang triển khai xây dựng trạm xử lý nước thải là: KCN Thạch Thất - Quốc Oai công suất giai đoạn 1 là 1500m³/ngày đêm, hiện tại đang khẩn trương hoàn thành giai đoạn lắp đặt thiết bị, dự kiến vận hành thử vào nửa cuối tháng 2/2013 và KCN Sài Đồng B công suất 3200m³/ngày đêm, dự kiến hoàn thành trong quý 4/2013. Như vậy, nếu tiến độ xây dựng hai trạm xử lý nước thải tập trung nói trên đúng như kế hoạch, thì kết thúc năm 2013 nước thải của toàn bộ các các KCN đang hoạt động của thành phố đều được xử lý trước khi xả ra nguồn tiếp nhận theo đúng quy định. Đây là yếu tố hàng đầu trong việc giảm thiểu ô nhiễm bảo vệ môi trường, góp phần quan trọng vào sự phát triển bền vững của Thủ đô.